Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Epb42P49222 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb42P49222 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms