Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rbp3P49194 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbp3P49194 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms