Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx3P48759 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx3P48759 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms