Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TgfaP48030 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TgfaP48030 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms