Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrprbP47758 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrprbP47758 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms