Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nedd4P46935 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms