Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1bP46414 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms