Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgavP43406 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgavP43406 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms