Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NodalP43021 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NodalP43021 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NodalP43021 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NodalP43021 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NodalP43021 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NodalP43021 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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