Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd1P40201 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms