Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FynP39688 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FynP39688 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FynP39688 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FynP39688 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FynP39688 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FynP39688 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FynP39688 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FynP39688 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FynP39688 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FynP39688 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FynP39688 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FynP39688 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FynP39688 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FynP39688 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FynP39688 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FynP39688 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FynP39688 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FynP39688 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FynP39688 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms