Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprkP35822 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprkP35822 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprkP35822 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprkP35822 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprkP35822 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms