Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Grin1P35438 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin1P35438 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms