Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TpoP35419 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TpoP35419 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TpoP35419 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TpoP35419 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TpoP35419 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms