Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab17P35292 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab17P35292 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab17P35292 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab17P35292 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms