Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifnar1P33896 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnar1P33896 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms