Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f3P31361 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f3P31361 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms