Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa2P31245 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa2P31245 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms