Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VtnP29788 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VtnP29788 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VtnP29788 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VtnP29788 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VtnP29788 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VtnP29788 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms