Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms