Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprmP28828 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PtprmP28828 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprmP28828 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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