Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apex1P28352 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apex1P28352 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms