Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pde6aP27664 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde6aP27664 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde6aP27664 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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