Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afxP27661 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afxP27661 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2afxP27661 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms