Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZfaP23607 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZfaP23607 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZfaP23607 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms