Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmbsP22907 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmbsP22907 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms