Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RarbP22605 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RarbP22605 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RarbP22605 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RarbP22605 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RarbP22605 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RarbP22605 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RarbP22605 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RarbP22605 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RarbP22605 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RarbP22605 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RarbP22605 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms