Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klra1P20937 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klra1P20937 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms