Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fcer1aP20489 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms