Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms