Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f1P17208 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms