Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms