Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd44P15379 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd44P15379 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd44P15379 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms