Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnmt1P13864 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnmt1P13864 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms