Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd1P13516 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd1P13516 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms