Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vpreb1P13372 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms