Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FosbP13346 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FosbP13346 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FosbP13346 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FosbP13346 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FosbP13346 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FosbP13346 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FosbP13346 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FosbP13346 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FosbP13346 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FosbP13346 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FosbP13346 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FosbP13346 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FosbP13346 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FosbP13346 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms