Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga5P11688 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms