Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DmdP11531 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DmdP11531 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DmdP11531 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DmdP11531 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DmdP11531 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DmdP11531 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DmdP11531 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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DmdP11531 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DmdP11531 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms