Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolP11369 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolP11369 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolP11369 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolP11369 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolP11369 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PolP11369 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms