Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms