Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb4P10284 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb4P10284 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms