Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csf3P09920 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms