Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc8P09025 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc8P09025 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc8P09025 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms