Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefmP08553 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefmP08553 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefmP08553 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefmP08553 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefmP08553 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefmP08553 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefmP08553 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NefmP08553 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NefmP08553 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NefmP08553 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefmP08553 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms