Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna4P07351 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna4P07351 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna4P07351 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna4P07351 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna4P07351 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna4P07351 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna4P07351 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifna4P07351 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna4P07351 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna4P07351 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna4P07351 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna4P07351 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna4P07351 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna4P07351 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna4P07351 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna4P07351 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna4P07351 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms