Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csf1P07141 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csf1P07141 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms