Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06344 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06344 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06344 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06344 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06344 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06344 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06344 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06344 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06344 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06344 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms