Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06335 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06335 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06335 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06335 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06335 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06335 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms