Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt1P04104 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms